Почему магнитола не выключается при зажигании?

Проверьте предохранители, замените сгоревшие...

магнитола какая? штатная или андроид?
у андроида надо в настройках поставить отключение (обычно делают с задержкой 3-10 секунд, чтобы при посадке с автозапуска она не перезапускалась).