Как определить неисправную катушку зажигания?

Конечно влияет. Если у вас не один модуль, а 2 или 4 отдельных катушки, то можно поменять их местами, если пропуски в зажигании сместятся вместе с катушками, значит проблема в них, если останутся там же, значит в цилиндре.

методом научного тыка))) т.е тупой заменой или осцилографом