Попробуйте форматы MPEG4, WMA, AVI... Если магнитола рассчитана для чтения видео с флэшки, то читать эти форматы должна без проблем. И попробуйте поставить машину на ручник, т. к. без него изображение может не транслироваться...
А кто вам сказал, что эта магнитолла вообще умеет читать видео с флешки? Вбейте модель магнитолы в Гугле, найдете ее характеристики. А вообще обычно прямо на морде магнитолы пишут какие форматы она читает. Если там нет ничего кроме DVD, значит она понимает фильмы только в виде DVD дисков, то есть Mpeg2