В Сервисе делал или переносной игрушкой, типа, ELM? Это, так-то, вообще не сканер, и коробку видеть он не умеет! Да и по системе - не более 10 - 15 % самых основных ошибок видит, да и как видит - поверхностно...
Значит, всё в норме. Профессиональный сканер не может не увидеть проблем, в том случае, если диагностику делает грамотный специалист. На всякий, как я уже писал, проверьте состояние ГРМ. Провалы - явный признак либо пропусков, либо смещения фаз... Проверьте состояние свечей, они тоже о многом могут рассказать... Компрессию замерьте, катушки проверьте - не пробивают ли...