Почему стекло не поднимается с кнопки?

Проедьте к тем специалистам, которые ставили сигналку, 99,9% за то, что причина в некорректном подключении, или что-то где-то ошиблись при подключении...

Сигналку ставили 4 года назад. Все работало все это время. Началось все после подключения сканера чтобы снять ошибку по инвертору после его замены. Могли что то задеть когда тянули шину из под руля?

"Вытянуть шину из-под руля" можно только в сказках для детей. Сканер подключается жгутом с фишкой OBD-II из своего комплекта к штатному диагностическому разъёму, для работы с которым он и предназначен. Случайно задеть что-то при подключении сканера физически невозможно.
Сделать изменения в программах работ блоков машины с помощью сканера возможно.
При предыдущих работах так была подключена по шине CAN сигналка Pandora DX-50.
Возможно, вы не предоставили специалисту при замене инвертора машины всех данных по сигналке.
Попросту, при подключении сигналки работу сделали, оплату получили, но ничего владельцу подробно, а тем более в письменном виде не сообщили.
Обращаться с ошибками по инвертору надо было к установщикам сигналки.