Почему пропали задняя и 3-4 скорость?

Возвращайтесь в СТО, в котором вам создали эту проблему и требуйте восстановление всех параметров авто. Чтобы машина была исправна. Можете пригрозить обращением в Комитет по Защите Прав Потребителей или судом.