Полностью от неё вы не избавитесь. Снизить вибрацию можно, если использовать рекомендуемое изготовителем масло, и заправлять топливом с октановым числом не ниже 95. Можно попробовать, дополнительно, промыть дроссель... Но, повторюсь, 3-х цилиндровый двигатель не может работать совершенно без вибрации, как, например, 4-х цилиндровый.